二氧化碳
二氧化碳是沼气中只次于的主要成分。不同类型的底物在发酵产沼气过程中都会产生二氧化碳。底物转化生成沼气是一个复杂的过程，涉及多个阶段和不同类型的微生物菌样，二氧化碳可形成于不同的阶段。在产阶段，二氧化碳作为电子受体，也可被转化成。
二氧化碳会减低沼气热值，如果需要增加沼气热值(如用作车用燃气或并入管网)，应分离除去二氧化碳。沼气作为其他用途，例如，沼气发电或集中供气，沼气含有二氧化碳不会有大的问题，但是，二氧化碳溶于冷凝水形成碳酸，对管道和沼气脱硫设备有预定的腐蚀。
低压湿式沼气气柜手动放空管作用：
1、当气柜用压缩空气实验运行升降正常后，投入正式生产前需要用惰性气体与沼气进行置换，可利用手动放空管；
2、当气柜运行中发生导轮与机座卡轨现象，导致气柜不能正常升降时，为阻止柜内压力太高破坏柜体，可泄压检修；
3、当种罩升降试验完成后时，打开罩顶截止阀，阻止发生抽真空现象，破坏柜体。
调节池
①连接贮存池的管道应定期清理。
②调节池应每年放空、清理1次，及时排除沉渣及杂物。
③正常运转后，每年排泥1~2次，应经常检查排泥阀，并进行保养。
厌氧反应器
①厌氧反应器的塔体、各种管道及闸阀应每年进行1次检查和维修。
②厌氧反应器的各种加热设备应经常除垢、清通。
③当采用热交换器加热时，管道和闸阀处的密封材料应每年更换。
④当采用螺旋桨等机械搅拌时，轴承应定期检查，添加润滑油，支承架的连接螺栓应经常检查和紧固。
⑤蒸气管道、沼气管道的冷凝水应按设计规定定期排放。
⑥寒冷地区冬季，对溢流管、防爆装置的水封应做好设备和管道保温防冻工作。
⑦厌氧反应器运行3~5年应清理、检修1次。
沼气工程配套设备坚持无害化原则
农业废弃物，尤其是畜禽粪便中大量的病原体，会给人畜带来潜在的危害。故在利用之前要进行粪便和污水的无害化处理，使其在利用时不会对牲畜和作物的生长产生不良影响：排放的污水和粪便不会对土地、地下水和地表水产生污染等。污水根据国家规定的标准，选择适宜的处理工艺和技术达标排放。而应用于还田的固体废弃物需要进行干燥和堆肥处理，达到无害化标准，以防止生物性污染。